发育不好的胚胎做药流后会自行从体内流掉。因为医生会开具一些特定的药物，例如米非司酮和米索前列醇，这些药物可以诱导子宫内膜蜕膜化和胎盘绒毛坏死，同时促进子宫收缩和软化宫颈，从而促使胚胎从体内排出，如果是在胚胎发育不良的情况下，女性体内同时也会产生一种自然淘汰的反应机制，比如当胚胎存在发育缺陷或者异常时，会自动将其排出体外，以避免异常胚胎对身体造成伤害。

药物流产是指用药物终止早孕的一种避孕失败的补救措施，也是常用的终止妊娠方法，有些人发现自己的胚胎发育并不好，也会使用药流将其排出体外，这通常是药物导致的自然排出，有些药物会刺激子宫收缩，从而使胚胎和内膜排出体外，也可能是身体自然淘汰造成的。

1、药物作用：药流时，医生会开具一些特定的药物，例如米非司酮和米索前列醇。这些药物可以诱导子宫内膜蜕膜化和胎盘绒毛坏死，同时促进子宫收缩和软化宫颈，从而促使胚胎从体内排出。当胚胎发育不良时，这些药物能够促使胚胎从子宫内排出。

2、自然淘汰：在胚胎发育不良的情况下，女性体内会产生一种自然淘汰的反应机制。当胚胎存在发育缺陷或者异常时，身体会自动将其排出体外，以避免异常胚胎对身体造成伤害。因此，药流后发育不好的胚胎也会被自然淘汰，从体内流掉。

3、子宫收缩：药流过程中，医生会给予一些促进子宫收缩的药物，如米索前列醇等。这些药物可以刺激子宫平滑肌收缩，从而使胚胎与子宫内膜剥离并排出体外。当胚胎发育不良时，子宫收缩的力量会更加明显，从而促使胚胎更快地从体内流掉。

总之，如果胚胎发育不好，而且自身体质比较弱，那么做药流后可能会因为药物作用等因素自行流掉，不过药流需要在医生的指导下进行，并且需要掌握正确的用药方法和注意事项，建议患者及时去正规医院，通过清宫手术等方式进行处理，从而达到改善疾病的效果。