吃了三个月叶酸最后生出的孩子还是畸形了的原因有叶酸摄入不足，染色体异常，不良生活习惯。虽然叶酸对于胎儿的神经管发育非常重要，但是如果孕妇摄入的叶酸量不足，可能会导致胎儿缺乏叶酸，从而增加神经管畸形的风险，如果父母的染色体存在异常，可能会导致胎儿的染色体出现异常，而且孕妇在怀孕期间的不良生活习惯，如吸烟、喝酒、接触有害物质等，都可能增加胎儿畸形的风险。

女性怀孕前三个月可以服用叶酸来预防胎儿畸形，但是要在医生指导下按剂量去服用，如果叶酸服用不足，可能会增加胎儿的畸形风险，导致最后即使服用了叶酸，生下来的孩子也是畸形的，此外，孕妇的染色体异常，不良生活习惯也会导致胎儿畸形，所以大家要注意。

1、叶酸摄入不足：虽然叶酸对胎儿发育非常重要，但并不是吃了叶酸就一定不会畸形。如果孕妇在怀孕期间叶酸摄入不足，可能会导致胎儿缺乏叶酸，从而增加畸形的风险。因此，孕妇在怀孕期间需要遵医嘱适当增加叶酸的摄入量。

2、染色体异常：即使孕妇在怀孕期间摄入足够的叶酸，如果女性18或者21号染色体出现异常，可能将异常的染色体遗传给胎儿造成畸形，比如智力比正常的孩子低下，且容易出现身材短小，以及面部畸形。

3、不良生活习惯：孕妇作息不规律可能导致内分泌紊乱，且严重时可能导致胎儿出现发育畸形的情况，孕妇在怀孕期间吸烟、喝酒、接触有害物质等，都可能增加胎儿畸形的风险。

总之，即使孕妇在怀孕期间摄入足够的叶酸，并且保持良好的生活习惯，也不能完全保证胎儿不会出现畸形，因此，孕妇在怀孕期间需要定期进行产前检查和筛查，及时发现和处理问题，如果孕妇在怀孕期间出现异常症状或胎儿发育异常，需要及时就医并接受专业的治疗。