由于营养不均、发育速度不同所致，也有可能是其中一个囊胚存在健康问题。试管怀孕双胞胎50天后，如果做B超检查提示一个孕囊大，一个孕囊小，不一样大一般是正常的，因为母体每天摄入的营养有限，就会导致两个孕囊吸收的营养不一，加上每个移植的胚胎生长和发育速度不可能存在一模一样的。如果相差比较大可能是小的那个存在发育不良，需后续做检查来确诊。

为了保证试管的成功率，对于不少患者来说医生会选择移植两个数量的胚胎到宫腔内，若是同时存活，那么就是双胞胎。而试管成功后和自然受孕一样，需要定期去医院做检查，比较常见的就是B超，若是在50天的时候做该检查发现两个孕囊大小不一样，那么可能是由于以下原因造成的：

1、营养不均

通常两个孕囊是独立的，可能会出现营养吸收不相同的情况，一般营养吸收较快就会大一点，营养吸收慢的另一个就会出现较小的情况，这时就会导致出现一个大一个小的现象。

2、发育速度不同

一般来说移植的两个胚胎质量和发育程度是存在不同的，所以移植到子宫后两个孕囊生长发育有可能速度不一样，质量好的通常要发育得更好些，所以出现大小差异的问题。

3、异常孕囊

两个孕囊大小异常可能是出现不健康的孕囊，到两个月左右时进行B超检查，查看胎芽和原始心管有无明显搏动，出现孕囊没有胎芽或是原始心管没有搏动情况，存在畸形或是发育迟缓的现象。

建议不要想太多，医生是专业人士，既然他说了没有异常情况，那么出现此现象大概率是由于前两个因素所致，实在放心不下，可以换一个医院再看看，或者看结果报告单上两个孕囊的数据相差大不大来做进一步判断。