不行，因为囊肿达到了5毫米，体积比较大，无论是生理性还是病理性的，都会不利于试管婴儿的相关治疗，毕竟试管需要经过降调、促排、取卵、体外培养、移植等多个环节，使用的药物多，很有可能会引起囊胚继续增大，同时造成其他疾病问题的出现，危及到生命健康，因此需要先通过手术或者其他的方式进行处理，等情况好转后再进行试管。

在进行试管治疗前，男女双方需要做一个全面的身体检查，以便医生了解具体的身体情况，制定合适的治疗方案，如果检查过程中发现右附件出现了囊肿，有5毫米，这通常是无法继续试管治疗的，必须先手术治疗后才能进行试管操作，无论生理性还是病理性，不然两种都会导致一定的影响，如下：

1、生理性：即使是生理性囊肿，体积达到了5毫米，也应先进行治疗，否则可能在试管过程中，造成囊肿的破裂，还有可能引起流产；

2、病理性：如果直径超过五厘米，短期内增长速度比较快，怀疑恶性病变了，这时候建议先处理囊肿如果延迟治疗或放任不管，则可能出现囊肿破裂、蒂扭转、感染等继发病变，不仅影响怀孕，还可能影响患者的健康。

不过，由于每个人的身体情况不同，所以也不能一概而论，需结合实际情况来看，建议将检查报告单拿给专业人士，让其给予一个建议。如果不影响试管，也不会造成其他的异常出现，那么是可以进行试管的，但如果风险高，后续容易出现严重问题，就不可以做试管了，建议要先进行手术切除。